Í Flakki og í Endalausu er fimmta hver alda boss-alda.
Þrír bossar
Fyrsti bossinn er alltaf sá klassíski: kubbur með skjöld sem sópar fram og aftur yfir borðið. Síðari bossar geta verið sá Sprungni, sem klofnar í tvennt, eða Vörðurinn, sem fjarflytur sig og múrar sig inni. Hver þeirra hefur sína eigin lífsstiku.
Fimmtán fornmunir
Eftir boss í Flakki velur þú fornmun: varanleg áhrif það sem eftir er hlaupsins, til dæmis Yfirhleðslukjarni, Sveimkjarni eða Mídasarkjarni. Þú velur einn af tveimur; sumir fornmunir opnast eftir því sem þú spilar.
Svo samruninn
Boss-alda er líka tíminn þegar þú getur brætt saman tvo fullnumda bolta. Sjá Boltasafnið.