I Rogue Run og i Uendelig er hver femte bølge en boss-bølge.
Tre bosser
Den første boss er altid klassikeren: en blok med skjold, der fejer hen over banen. Senere bosser kan være den Flækkede, der deler sig i to, eller Vogteren, der teleporterer og murer sig inde. Hver har sin egen livsbjælke.
Femten relikvier
Efter en boss i Rogue Run vælger du en relikvie: en varig effekt resten af din run, for eksempel Overopladet Kerne, Sværmkerne eller Midaskerne. Du vælger én ud af to; nogle relikvier låses op, mens du spiller.
Så fusionen
En boss-bølge er også der, hvor du kan smelte to mestrede bolde sammen. Se Boldarsenalet.